Tindakan prediktif oncomiR dalam menekan jalur pensinyalan TP53 pada garis sel kanker usus besar yang dikondisikan hipoksia HCT-116

Hipoksia yang terjadi pada kanker kolorektal (CRC) secara signifikan memengaruhi kelangsungan hidup pasien dengan mendorong terjadinya resistansi terhadap kemoterapi. Kondisi ini mengubah regulasi mikroRNA (miRNA), yang merupakan pengatur utama berbagai proses penting seperti proliferasi, apoptosis, dan invasi, sehingga berkontribusi terhadap progresivitas tumor. Meskipun miRNA memiliki potensi besar sebagai target diagnostik dan terapeutik, mekanisme mendasar yang menjelaskan bagaimana miRNA memengaruhi tumorigenesis yang dimediasi oleh hipoksia masih belum banyak dipahami.

Penelitian ini bertujuan untuk mengungkap peran miRNA pada sel punca kanker kolorektal (cancer stem cells, CSCs) HCT-116 di bawah kondisi hipoksia, guna memberikan pemahaman yang lebih mendalam tentang peran miRNA dalam proses adaptasi dan progresi tumor. Ekspresi miRNA dianalisis menggunakan Nanostring nCounter, dan dilakukan analisis bioinformatika untuk menjelaskan jalur molekuler yang terlibat. Sebanyak 50 jenis miRNA teridentifikasi dengan jumlah rata-rata ≥ 20 pembacaan (reads) untuk analisis ekspresi komparatif.

Hasil penelitian menunjukkan bahwa kondisi hipoksia menyebabkan peningkatan ekspresi pada 36 oncomiR pada sel HCT-116 dan 14 suppressor-miR pada sel punca mesenkimal (mesenchymal stem cells, MSCs). Peningkatan ekspresi miRNA tersebut terjadi secara konsisten dari kondisi normoksia ke hipoksia dan menunjukkan perbedaan yang signifikan antara MSCs dan HCT-116. Selain itu, miR-16-5p dan miR-29a-3p ditemukan berperan dominan dalam mengatur jalur pensinyalan p53, yang diduga berhubungan dengan mekanisme sel untuk bertahan terhadap hipoksia dan mempertahankan proliferasi sel.

Penelitian lanjutan dengan pendekatan poros genom-transkriptom diperlukan untuk memahami secara komprehensif peran miRNA dalam proses adaptasi sel CRC dan MSC terhadap hipoksia. Penelitian berikutnya juga dapat difokuskan pada pengembangan biomarker spesifik untuk diagnosis. Selain itu, anti-miR berpotensi dikembangkan sebagai terapi untuk mencegah proliferasi kanker atau menghambat adaptasi sel kanker terhadap kondisi hipoksia.